文明6轰炸机不能轰炸首都吗？

可以的，文明6中无论是战斗机还是轰炸机都是可以轰炸其他文明的首都的，甚至玩家可以通过核弹攻击其他文明的首都。前提是玩家已经和该文明宣战。